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高质量的核酸提取助力新生儿遗传病的早筛早诊

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2026-05-08

为减少胎儿出生缺陷的发生,世界卫生组织(WHO)提出了围绕女性孕早期、孕期(产前)和新生儿出生的三级预防策略。

一级预防:指防止出生缺陷婴儿的发生具体措施包括健康教育、婚前医学检查、孕前保健、遗传咨询、计划生育、避免接触放射线和有毒有害物质、避免接触高温环境;主要在孕前及孕中开展,涵盖脊髓性肌肉萎缩症(SMA)基因检测、脆性X综合症携带者筛查(FXS)、叶酸代谢能力基因检测、遗传性耳聋基因检测等153种疾病。

二级预防领域:指减少严重出生缺陷儿的出生,主要是再孕期通过早发现、早诊断和早采取措施。以减少严重出生缺陷儿的出生;主要在产前阶段开展,针对染色体非整倍体筛查-无创产前基因检测NIPT及NIPT Plus,针对基因组病异常诊断-染色体拷贝数变异检测(CNV-seq);针对单基因病异常诊断-产前全外显子组检测(WES)。

三级预防领域:指进行新生儿遗传病筛查,主要对大分子病、小分子病等的筛查,对出生缺陷儿及早发现和治疗,尽量改善其预后。主要是对新生儿开展基因筛查,涉及遗传代谢病,血液系统疾病,免疫相关疾病及其他新生儿、婴幼儿高发、可防、可治性遗传病,以及运用全外显子组测序(WES)和全基因组测序(WGS)进行全面筛诊。全外显子组测序(WES)和染色体拷贝数变异检测(CNV-seq)为核心技术。

图:三级预防策略

新生儿筛查通过早期发现先天性遗传代谢病,实现早诊断、早治疗,显著改善患儿预后。根据《中国出生缺陷防治报告(2012)》的数据,我国出生缺陷的发生率大约为5.6%,其中80%为遗传病。遗传病的检测依赖于高质量的核酸提取与基因检测技术。样本采集是基因筛查的基础,需满足“便捷、微创、稳定、适配核酸提取”的原则,结合新生儿生理特点,临床常用样本类型主要包括干血斑样本、外周全血样本,特殊场景下可采用羊水样本,具体如下:

(1)滤纸干血斑(Dried Blood Spot, DBS)样本:干血斑是新生儿遗传代谢病筛查的经典样本类型,具有采集方便、运输便捷、稳定性好等优势。采集方法是采集新生儿足跟内侧或外侧缘,采集3个直径≥8mm的血斑于专用滤纸片上,确保血斑均匀渗透、无溶血、无空白,采集后自然晾干(避免堆叠、烘烤或阳光直射),干燥后装入密封袋,4℃冷藏运输至实验室,24小时内完成核酸提取可最大限度保证DNA完整性。

该样本类型适配地贫与耳聋基因的常规筛查,可通过打孔取样进行核酸提取,但其也存在一定局限性:若血斑采集不规范(如血量不足、溶血、污染),会导致核酸得率低、纯度差;长期储存(超过6个月)可能导致DNA降解,影响后续检测。

(2)外周全血样本:主要用于干血斑样本检测结果异常后的复核,或针对有家族遗传史、高危因素的新生儿进行精准筛查。采集方法为:采用EDTA抗凝管(紫色帽),采集新生儿外周静脉血2-3mL,轻轻颠倒混匀5-8次,避免剧烈震荡导致红细胞破裂溶血;采集后4℃冷藏保存,24小时内完成核酸提取,若无法及时提取,可置于-80℃冷冻保存,避免反复冻融。

外周全血样本中白细胞含量高,核酸得率高、纯度好,能满足高灵敏度基因检测(如高通量测序)的需求,但采集过程相对复杂,对新生儿有一定创伤,不适用于大规模筛查。

(3)羊水样本:主要用于产前地贫与耳聋基因携带者筛查,针对夫妻双方均为基因携带者、有生育重型患儿风险的孕妇,在孕16-24周由专业医师行羊膜穿刺术,抽取20-30mL羊水,离心获取胎儿脱落细胞,置于无菌离心管中,4℃冷藏运输,24小时内完成核酸提取。

该样本类型可直接反映胎儿基因状态,为产前干预提供依据,但采集属于有创操作,存在一定的流产风险,需严格遵循临床操作规范,同步进行细胞培养备份以防检测失败。

(4)口腔拭子/唾液样本:近年来,口腔拭子/唾液样本在携带者筛查或者大龄儿童复查中的应用逐渐增多,尤其适用于产前筛查场景。唾液采集无创、可居家完成,适合大规模人群筛查,但需注意样本中抑制物对后续核酸提取的影响,如易受食物残留或口腔菌群干扰。

针对不同的样本,高质量的核酸提取至关重要。在大规模筛查中,手工提取误差大、效率低。推荐使用磁珠法自动化提取仪,以保证批内和批间的一致性(CV值<5%)。翌圣生物为新生儿遗传病筛查提供高质量的核酸提取产品。

翌圣生物自主研发MolPure® Magnetic Spots DNA Kit磁珠法干血斑DNA提取试剂盒(18554ES)适用于从干血斑或血卡样本中提取高纯度的基因组 DNA,该方法采用磁珠纯化技术,提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提,安全无毒且快捷。得到的产物可直接用于 PCR、qPCR、文库构建等实验。配合磁珠法自动化提取仪器使用,可实现核酸的高通量提取。

产品性能展示

干血斑样本采用18554和竞品A和竞品B平行提取,搭配16通道核酸提取仪或手动提取;提取产物进行nanodrop 定量、琼脂糖凝胶电泳,结果如下,18554ES对干血斑样本提取的核酸得率优于竞品。

图:干血斑样本提取结果

MolPure® Magnetic Blood DNA Kit 磁珠法血液 DNA 提取试剂盒(18504ES)适用于血液样本的基因组DNA的提取。采用独特的磁珠和精心优化的缓冲体系,可最大限度的分离纯化高纯度DNA。提取的基因组DNA纯度高,质量稳定可靠,适用于各种下游应用实验,如酶切,PCR、qPCR等。

产品性能展示:取200 μL的拭子保存液,采用18504和竞品K进行提取,其中18504搭配翌圣96通道提取仪提取,70 μL的洗脱体积;提取产物进行nanodrop 定量、琼脂糖凝胶电泳,结果如下,实验结果显示18504ES对拭子的提取条带比竞品亮,纯度更好。

图:拭子样本提取结果

MolPure® Mag96 Blood DNA Kit FR 磁珠法96孔血液DNA提取试剂盒FR(预封装)(18362ES)可实现一步法提取,提取过程中无需补充异丙醇;采用独特的磁珠和精心优化的缓冲体系,可最大限度的分离纯化高纯度 DNA。提取的基因组 DNA 纯度高,质量稳定可靠,适用于各种下游应用实验,如酶切、PCR、qPCR 等。配合 96 通道自动化核酸提取仪器使用,可实现核酸的高通量提取。

产品性能展示:200 uL 冻存血样本,70 uL洗脱体积;提取仪器:96通道提取;实验结果显示针对全血样本提取,提取浓度与竞品相当,提取纯度优于竞品。

图:冻存血样本提取结果

【翌圣·全血/口腔拭子DNA核酸提取·产品选择指南】

产品类别

产品名称

货号

磁珠法血液 DNA 提取

MolPure® Magnetic Blood DNA Kit 磁珠法血液 DNA 提取试剂盒

18504ES

MolPure® Mag96 Blood DNA Kit FR 磁珠法96孔血液DNA提取试剂盒FR(预封装)

18362ES

MolPure® Magnetic Spots DNA Kit磁珠法干血斑DNA提取试剂盒

18554ES

核酸提取仪

16通道核酸提取仪

80512ES

48通道自动化核酸提取仪

80511ES

96通道自动化核酸提取仪

80510ES

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