Cell|北京大学孔道春:发现RNA-DNA杂交链中间体

DNA同源重组是生命体的基本生物事件,是遗传物质DNA代谢(DNA复制,重组,修复)的三种主要途径之一。所以,阐明DNA同源重组的分子机制显得尤为重要。目前,已知的DNA同源重组的步骤(如图1):

1)链末端切除核酸酶DNA2对DNA双链断裂处进行5’-链降解,切除大约几千个核苷酸,导致3’-单链DNA形成;

2)3’-单链DNA入侵同源DNA模板链通过多个蛋白帮助,Rad51包裹 3'-单链DNA形成核酸-蛋白复合体,该复合体侵入同源DNA链, 3'-单链DNA作为引物进行DNA合成;

3)解开Holliday Junction(HJ)结构3’-单链DNA侵入同源DNA模板链后,进行DNA合成及链交换反应,并最终完成DNA同源重组过程。

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图1. 同源重组具体过程

图源:Sung P, Klein H (2006). "Mechanism of homologous recombination: mediators and helicases take on regulatory functions". Nature Reviews Molecular Cell Biology 7: 739-750.

在DNA同源重组领域,有一个关键问题尚未阐明—细胞是如何进行末端切除5’-链的核苷酸,但又保证3’-链的绝对完整呢?过去二三十年,大家普遍接受的观点是:3’-单链是通过RPA(replication protein A)的结合来保护的。但是,此观点缺乏确切的实验依据。

 

2021年3月4日,北京大学生命科学学院孔道春课题组在Cell(IF 38)上发表了一篇题为RNA polymerase III is required for the repair of DNA double-strand breaks by homologous recombination的研究论文。此研究发现3’-单链DNA是通过形成暂时的RNA-DNA杂交链来得到保护,催化此RNA链合成的是RNA聚合酶III。RNA-DNA杂交链中间体的发现将推进解决真核细胞DNA同源重组领域里疑难问题的解决,并有助于科研人员对DNA同源重组分子机制更深层次的理解,同时,也将促进疾病的基因治疗、抗癌药物的研发等。

 
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点此查看原文,以上新闻来源于北京大学新闻网)

 

在这项研究中,该团队选择使用了翌圣的qPCR mix用于相关基因的RT-qPCR分析。以下截图来源于文章:
 

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除了上述产品外,翌圣还有多款qPCR产品供您选择。

 

翌圣qPCR产品选择指南

 

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1、适用于所有qPCR机型,再也不用根据仪器调整ROX浓度

 

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图2. Hieff UNICON® Universal Blue 预混液可实现全平台通用。针对不同仪器平台,与T品牌对比,Hieff UNICON® Universal Blue 预混液Ct值起峰更加靠前。以2µl的质粒10倍梯度稀释液为模板,扩增IL23R基因。

 2、灵敏度高,可检测低至单拷贝的质粒DNA

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图3.Hieff UNICON® Universal Blue 预混液可有效检测7个数量级范围的模板量,扩增效率高,可在宽广的线性范围内获得良好的线性关系。以2µl的106-100拷贝/µl的质粒为模板,扩增人IL23R基因。


翌圣qPCR mix发表的其它文献(部分高分)

 

1. Lu, XY., Shi, XJ., Hu, A. et al. Feeding induces cholesterol biosynthesis via the mTORC1–USP20–HMGCR axis. Nature (2020). (IF 43)

2. Wentao Dong et al. An SHR-SCR module specifies legume cortical cell fate to enable nodulation. Nature (2020)(IF 43)

3. Han X., et al., Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-Seq[J]. Cell. 2018 Feb 22;172(5):1091-1107.e17. (IF 30.410)

4. Wang X, Ni L, Wan S, et al. Febrile temperature critically controls the differentiation and pathogenicity of T helper 17 cells[J]. Immunity, 2020, 52(2): 328-341. e5. (IF 21.522)

5. Xiao J, Li W, Zheng X, et al. Targeting 7-Dehydrocholesterol Reductase Integrates Cholesterol Metabolism and IRF3 Activation to Eliminate Infection[J]. Immunity, 2020, 52(1): 109-122. e6.(IF 21.522)

6. Han F, Liu X, Chen C, et al. Hypercholesterolemia risk-associated GPR146 is an orphan G-protein coupled receptor that regulates blood cholesterol levels in humans and mice[J]. Cell Research, 2020, 30(4): 363-365.(IF 20.5)

 

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