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极简转录组建库试剂盒,快速玩转RNA-seq

一、背景介绍

转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。通过对某一物种的mRNA进行高通量测序,能够在单核苷酸水平对特定物种的整体转录活动进行检测,从而全面快速地获得该物种在某一状态下的几乎所有转录本信息。由于转录组测序可以得到全部RNA转录本的丰度信息,加之准确度又高,使其具有广泛的应用。

转录组测序根据待测样品的物种分为真核转录组和原核转录组。真核生物与原核生物mRNA的结构不同,所以前期富集的方法也有所不一致。

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1. 真核生物与原核生物mRNA 的区别

 

真核生物mRNA中含有poly-A尾结构,因此可以使用oligo-T修饰的磁珠进行特异性的富集mRNA;而原核生物并不像真核生物mRNA具有poly-A的结构,因此,无法直接利用oligo-T磁珠将mRNA纯化出来,因而原核生物一般来说,可以通过反向富集的方法,即去除Total RNA中rRNA进行目标RNA的富集。之后再通过片段化,逆转录一链合成,二链合成以及末修加A,接头连接,文库扩增等步骤,形成可上机测序的文库。

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2. 翌圣提供不同mRNA富集方法建库解决方案

二、产品推荐

 

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Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit是一款高效RNA文库构建试剂盒,通过流程优化,将二链成,末修加A等步骤合并为一步完成,大大降低实验操作时间,同时用户可自行选择RNA富集模块进行文库构建。

 

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三、性能展示

(一)rRNA去除反向富集

样本信息:不同DV200 Human FFPE RNA

试剂盒:翌圣:Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep KitCat#12252)

竞品:N*品牌其他试剂:

rRNA去除:Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit rRNA & ITS/ETS)(Cat#12257)

RNA纯化:Hieff NGS® RNA Cleaner(Cat#12602)

DNA纯化:Hieff NGS® DNA Selection Beads(Cat#12601)

文库定量:dsDNA HS Assay Kit for Qubit®(Cat#12640)

建库接头:Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for Illumina® (Cat#12414)

 

1.下机数据展示

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*DV200
 表示样本中大于200nt的RNA 片段所占的比例,对于降解严重的FFPE 样本,DV200值能够更好的反应样本的质量。

 

2.一致性对比分析

 

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(二)Oligo-dT磁珠富集

 

样本信息:模式作物拟南芥 RNA试剂盒:

翌圣:Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep KitCat#12252)

竞品:N*品牌、V*品牌

其他试剂:

mRNA纯化:Hieff NGS® mRNA Isolation Master KitCat#12603

DNA纯化:Hieff NGS® DNA Selection Beads(Cat#12601)

文库定量:dsDNA HS Assay Kit for Qubit®(Cat#12640)

建库接头:Hieff NGS® RNA 384 CDI Primer for Illumina® (Cat#12414)

1.文库下机数据展示

 

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2.一致性对比分析

 

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四、订购信息

分类

名称

货号

规格

 

rRNA去除试剂盒

Hieff NGS® MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS)

12257ES

24/96T

Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

12253ES

24/96T

Hieff NGS® MaxUp rRNA Depletion Kit (Plant)

12254ES

24/96T

 

RNA建库试剂盒

Hieff NGS® Ultima Dual-Mode RNA Library Prep Kit for Illumina®

12252ES

24/96T

Hieff  NGS® Ultima Dual-Mode RNA Library Prep Kit for MGI®

13333ES

24/96T

 

mRNA建库试剂盒

Hieff NGS® Ultima Dual-mode mRNA Library Prep Kit for Illumina®

12301ES

24/96T

Hieff  NGS® Ultima Dual-mode mRNA Library Prep Kit for MGI®

13330ES

24/96T

 

HB210129